Neliječena kanalizacija: Neadekvatna sanitarna infrastruktura u zajednicama koje okružuju jezero Victoria rezultira da sirova ili djelomično tretirana kanalizacija ulazi u vode jezera.
Poljoprivredni otjecanje: Prekomjerna upotreba gnojiva i pesticida u obližnjim poljoprivrednim aktivnostima predstavlja prijetnju kvaliteti vode jezera. Otok donosi zagađivače, uključujući nitrate, fosfate i pesticide, u jezero, što dovodi do eutrofikacije i štetnih cvjetanja algi.
Urbano otjecanje: Neupravljeno urbano otjecanje koje nose smeće, kemikalije i onečišćujuće tvari pronalazi svoj put u jezero tijekom kišnih događaja, što je dodatno ugrožavajući kvalitetu vode.
Industrijski ispuštanje: Industrije smještene oko otpadnih voda otpuštanja jezera koje sadrže potencijalno štetne kemikalije i teške metale u jezero.
Ribolovni prakse: Ilegalne ribolovne prakse doprinose padu kvalitete vode ometajući staništa i ometajući ekološku ravnotežu jezera.
Voda jezera Victoria može biti sigurna za piće pravilnim procesima liječenja kao što su filtracija, dezinfekcija i pročišćavanje. Okakanje vode prije konzumacije također je uobičajena metoda za sigurno pijenje u područjima oko jezera. Zajednice i institucije koje rade na podizanju svijesti i rješavanju ovih pitanja kvalitete vode igraju ključnu ulogu u poboljšanju kvalitete i zdravlja jezera.