* Klimatske promjene: Promjene temperature, oborina i drugih klimatskih čimbenika mogu promijeniti fizičke i kemijske uvjete vodenih ekosustava, što zauzvrat može dovesti do promjena u biljnim i životinjskim zajednicama koje tamo žive.
* zagađenje: Zagađenje iz ljudskih aktivnosti također može izmijeniti fizičke i kemijske uvjete vodenih ekosustava, a također može uvesti štetne kemikalije koje mogu izravno ili neizravno naštetiti vodenim organizmima.
* Promjene upotrebe zemljišta: Promjene u korištenju zemljišta mogu izmijeniti količinu sedimenata i hranjivih sastojaka koji ulaze u vodene ekosustave, kao i količinu svjetlosti koja prodire u vodu. To može dovesti do promjena u biljnim i životinjskim zajednicama koje tamo žive.
* Biološke interakcije: Konkurencija, predator i druge biološke interakcije također mogu igrati ulogu u vodenoj sukcesiji. Na primjer, ako se u vodeni ekosustav uvede novi grabežljivac, može plijeniti i smanjiti populaciju određenih vrsta plijena. To tada može dovesti do promjena u populaciji drugih vrsta koje su ili konkurenti ili plijen pogođenih vrsta.
Vodena sukcesija je složen proces na koji utječu razni čimbenici. Važno je razumjeti ove čimbenike kako bi se upravljali i zaštitili vodeni ekosustavi.