Lov i probijanje :Jeleni miša love se zbog svog mesa, krzna i rogova, koji se koriste u tradicionalnoj medicini. Kvaj za ilegalnu trgovinu divljim životinjama također predstavlja značajnu prijetnju. Potražnja za dijelovima jelena miša na crnom tržištu pokrenula je preteše, što je dovelo do pada stanovništva.
Uvođenje invazivnih vrsta :Uvođenje invazivnih vrsta, poput divljih mačaka, pasa i mongooza, imalo je štetan utjecaj na populaciju jelena miša. Oni su uvedeni grabežljivci plijeni na jelene miša i natječu se za hranu i resurse, dodatno smanjujući njihove šanse za preživljavanje.
bolest :Jelen miša također su osjetljivi na bolesti, poput bolesti stopala i usta i tuberkuloze, koje se mogu proširiti kontaktom sa zaraženom stokom ili drugim životinjama. Te bolesti mogu uzrokovati masovne smrtnosti i utjecati na cjelokupno zdravlje i otpornost populacije jelena miša.
Klimatske promjene :Očekuje se da će klimatske promjene pogoršati prijetnje s kojima se suočava jeleni miš. Promjene temperature, oborina i raspodjele vegetacije mogle bi utjecati na njihovo stanište, dostupnost hrane i interakcije s drugim vrstama, čineći ih ranjivijim na pad.
Da bi se ublažile ove prijetnje i spriječile da jeleni miš izumire, potrebni su napori za zaštitu očuvanja kako bi se zaštitili njihovo preostalo stanište, smanjili lov i provalili, upravljali invazivnim vrstama i borili se protiv širenja bolesti. Uz to, ključno je rješavati klimatske promjene i njezine potencijalne utjecaje na jelene miša i njihove ekosustave.