2. Krivolov i lov: Bonoboi se love zbog mesa, a ponekad i zbog ilegalne trgovine kućnim ljubimcima. Trgovina mesom divljači predstavlja ozbiljnu prijetnju, jer se bonoboi ubijaju zbog mesa i prodaju na lokalnim tržnicama.
3. Prijenos bolesti s ljudi: Blizina ljudske populacije također može utjecati na bonobe zbog prijenosa bolesti. Zarazne bolesti, poput respiratornih infekcija i virusa ebole, mogu biti kobne za čovjekolike majmune, uključujući bonobe.
4. Ograničeni raspon: Bonoboi imaju relativno mali prirodni areal u usporedbi s drugim vrstama velikih majmuna, uglavnom ograničenih na bazen Konga u Demokratskoj Republici Kongo. Ovaj ograničeni raspon ih čini osjetljivijima na utjecaje gubitka staništa, krivolova i ljudskih uznemiravanja.
5. Spora reprodukcija: Bonoboi, poput drugih čovjekolikih majmuna, imaju dug životni vijek, ali sporu stopu razmnožavanja. To znači da se njihove populacije sporo oporavljaju od utjecaja lova, bolesti ili gubitka staništa, povećavajući rizik od ugrožavanja.
6. Nedostatak svijesti: Sve do nedavno, bonobi su dobivali manje pozornosti i resursa za očuvanje od drugih vrsta velikih majmuna. Ovaj nedostatak svijesti i određivanja prioriteta pridonio je njihovom ranjivom statusu.
Ulažu se napori putem organizacija za očuvanje, zaštićenih područja, mjera protiv krivolova i podizanja svijesti kako bi se zaštitile preostale populacije bonoba i očuvalo njihovo stanište. Međutim, stalne prijetnje i politička nestabilnost u Demokratskoj Republici Kongo čine očuvanje bonoba izazovnim pothvatom.