Fitoplankton: Cvjetanje algi često uključuje brzi rast određenih vrsta fitoplanktona, mikroskopskih algi koje čine osnovu hranidbenog lanca u vodenom okolišu. Dok je neki fitoplankton koristan kao izvor hrane za zooplankton, pretjerani rast može dovesti do neravnoteže u ekosustavu.
Zooplankton: Zooplankton su male životinje koje se hrane fitoplanktonom. Tijekom cvjetanja algi, nagli porast obilja fitoplanktona može dovesti do brzog porasta populacije zooplanktona. Međutim, kako cvjetanje algi opada, zooplankton se može suočiti s nedostatkom hrane, što dovodi do smanjenja populacije i smanjene dostupnosti hrane za više trofičke razine.
Riba: Ribe se oslanjaju na zooplankton kao primarni izvor hrane. Kada se populacije zooplanktona smanjuju zbog posljedica cvjetanja algi, ribe se mogu suočiti sa smanjenom dostupnošću hrane. To može utjecati na njihov rast, reprodukciju i cjelokupno zdravlje, što dovodi do potencijalnog smanjenja populacije riba.
Bentoški organizmi: Bentoski organizmi žive na dnu jezera ili blizu njega. Cvjetanje algi može stvoriti guste prostirke na površini vode, blokirajući sunčevu svjetlost da dopre do bentoske zone. Ova smanjena dostupnost svjetla može negativno utjecati na fotosintezu i rast bentoskih biljaka, koje služe kao hrana i stanište raznim organizmima.
Smanjenje otopljenog kisika: Tijekom cvatnje algi, prekomjerni rast algi troši veliku količinu kisika tijekom fotosinteze. Kako alge umiru i razgrađuju se, oslobađaju organsku tvar u vodu, dodatno povećavajući potrošnju kisika od strane razlagača. Ovaj proces može dovesti do iscrpljenosti kisika, stvarajući hipoksične uvjete koji stvaraju stres ili ubijaju vodene organizme.
Fluktuacije pH i ugljičnog dioksida: Cvjetanje algi može promijeniti pH i razine ugljičnog dioksida u vodi. Tijekom dana, intenzivna fotosinteza algi može povećati pH i smanjiti razinu ugljičnog dioksida. Suprotno tome, noću, kada fotosinteza prestane, alge dišu i oslobađaju ugljični dioksid, snižavajući pH i povećavajući razinu ugljičnog dioksida. Ove fluktuacije mogu poremetiti respiratorne i metaboličke procese drugih vodenih organizama.
Toksini i alelopatija: Cvjetanje nekih algi uključuje rast štetnih vrsta algi koje proizvode toksine. Ti se toksini mogu akumulirati u vodi i utjecati na različite organizme, uključujući ribe, zooplankton i druge vodene organizme. Osim toga, određene alge mogu ispuštati alelopatske tvari koje inhibiraju rast ili preživljavanje drugih organizama, dodatno narušavajući ekosustav.
Općenito, cvjetanje algi može poremetiti osjetljivu ravnotežu ekosustava ribnjaka mijenjajući hranidbene mreže, uzrokujući gubitak kisika, unošenje toksina i utječući na cjelokupno zdravlje i opstanak različitih vodenih organizama.