- gubitak staništa: Morski konji žive u plitkim vodama u blizini koralnih grebena, koje sve više prijete ljudskim aktivnostima poput zagađenja, prekomjernog ribolova i obalnog razvoja. Uništavanje njihovog staništa može smanjiti dostupnost hrane i skloništa, što otežava preživljavanje morskih konja.
- Predacija: Morske korijene plijene razne životinje, uključujući ribe, ptice i morske sisavce. Njihovo sporo kretanje i loš vid čine ih lakim ciljevima za grabežljivce.
- Natjecanje za hranu: Seahors se hrane malim rakovima i drugim planktonom. Moraju se natjecati s drugim životinjama za hranu, a njihova mala veličina i slaba sposobnost plivanja mogu im otežati uhvatiti svoj plijen.
- bolest: Morski konji osjetljivi su na razne bolesti, uključujući bakterije, viruse i parazite. Te bolesti mogu uzrokovati ozbiljne zdravstvene probleme, pa čak i smrt.
- Klimatske promjene: Klimatske promjene uzrokuju da oceani postanu topliji i kiseliji, što može imati negativne učinke na morske konjice. Toplije temperature vode mogu naglasiti morske konjice i učiniti ih osjetljivijim na bolest. Još kisela voda može otopiti kalcijev karbonat koji morske konjice koriste za izgradnju svojih kostura, čineći ih slabijim i osjetljivijim na grabežljivce.