Crni ili smeđi pigment koji se nalazi kod konja naziva se melanin. Melanin je pigment koji je odgovoran za obojenje kože, kose i očiju. Kod konja melanin proizvodi stanice zvane melanociti. Melanociti se nalaze u koži, folikulima kose i tkivu očiju. Količina melanina koju proizvode melanociti određuje boju konja. Konji s puno melanina imat će crni ili smeđi kaput, dok će konji s manje melanina imati lagano obojeni kaput.