Prema Međunarodnoj uniji za očuvanje prirode (IUCN), neke vrste morskih konja smatraju se ranjivim na ugrožene, a pad stanovništva opažen u mnogim regijama. Na primjer, IUCN crveni popis klasificira sljedeće vrste kao ranjive:
1. Hipokampus dolazi (obloženi morski konj):pronađen u zapadnom Tihom oceanu, ovoj vrsti ugroženo je uništavanje staništa i prekomjerno ribolov.
2. Hipokampus Trimaculatus (morski konj s tri lista):porijeklom iz indo-pacifičke regije, ovaj morski konj je podložan gubitku i prikupljanju staništa za tradicionalnu medicinu.
3. Hipokampus hipokampus (Spiny Sea Horse):distribuiran u Sredozemnom moru i istočnom Atlantiku, ova se vrsta suočava s prijetnjama od obalnog razvoja i ribolovnog pritiska.
4. Hipokampus erectus (morski konj Giraffe):Naseljavajući tropske vode indo-pacifičkog, morski konj Giraffeov je podložan degradaciji staništa i prekomjernog ribolova.
Ove procjene naglašavaju potrebu za očuvanjem napora i održivih praksi upravljanja kako bi se zaštitila populacija morskih konja i osigurala njihov opstanak usprkos raznim prijetnjama s kojima se suočavaju.