Jaguari preferiraju gustu vegetaciju s pristupom izvorima vode, jer su vješti plivači i često love i piju u blizini vodenih tijela. Oni uspostavljaju domove koji se razlikuju u veličini ovisno o dostupnosti plijena, ali mužjaci mogu pokriti nekoliko stotina četvornih kilometara.
U okviru svojih staništa, Jaguari igraju ključne ekološke uloge kao vrhunski grabežljivci, pomažući u održavanju ravnoteže ekosustava reguliranjem populacije plijena. Oni su samotne životinje i često zauzimaju staništa s različitim vrstama plijena, poput jelena, peciva, kapibara, tapira i mnogih drugih.
Napori o očuvanju Jaguara uključuju očuvanje i zaštitu svojih staništa kako bi se osiguralo dugoročno preživljavanje ovih veličanstvenih i ekološki važnih mačjih grabežljivca.