Filipinski orao (Pithecophaga jefferyi): Ova veličanstvena ptica grabljivica smatra se nacionalnom pticom Filipina i nalazi se u prašumama u dolini Cagayan.
Cagayan plava muharica (Cyornis sanfordi): Ova upečatljiva ptica nalazi se u šumama Cagayana i obližnjih provincija.
Sjeverni luzonski oblačni štakor (Crateromys schadenbergi): Ovaj jedinstveni glodavac odlikuje se mekim, gustim krznom i velikim očima.
Luzonski golub s krvavim srcem (Gallicolumba luzonica): Prepoznatljivi golub poznat po crvenom prsnom perju u obliku ''krvarećeg srca''.
Luzonski tariktički kljunorožac (Penelopides manillae): Velika i šarena vrsta kljunoroga koja se nalazi u prašumama.
Osim ovih vrsta, endemi za regiju doline Cagayan također uključuju razne gmazove, vodozemce, kukce i morski život, a još vrsta bi se moglo otkriti kako se znanstveno istraživanje nastavi.