* Gubitak staništa: Stanište čileanskih Flaminga prijeti ljudskim aktivnostima, poput rudarstva, poljoprivrede i urbanog razvoja.
* Lov: Čileanski flamingosi love se za svoje meso, perje i jaja.
* zagađenje: Zagađenje od rudarstva, poljoprivrede i ljudskog otpada također je prijetnja čileanskom flamingu.
* Klimatske promjene: Klimatske promjene također su glavna prijetnja čileanskom flamingu, jer uzrokuje da se njihovo stanište mijenja i postanu manje prikladni za njihov opstanak.
Čileanski flamingo je ranjiva vrsta, a njegova populacija se smanjuje. Ako se te prijetnje ne riješe, čileanski flamingo u budućnosti može izumrijeti.