Aseksualna reprodukcija:Mnogi jednoćelijski organizmi reproduciraju se aseksualno, što znači da proizvode potomstvo genetski identične sebi. U takvim slučajevima koncept križanja i razmjene genetskog materijala između različitih pojedinaca postaje nevažan.
Nedostatak jasnih granica:jednoćelijski organizmi često postoje kao populacija, gdje pojedinci mogu razmjenjivati genetski materijal kroz različite mehanizme poput konjugacije, transformacije ili transdukcije. Ovi se procesi mogu dogoditi između genetski raznolikih pojedinaca, što otežava razgraničenje različitih granica vrsta temeljenih samo na križanju.
Horizontalni prijenos gena:Horizontalni prijenos gena uobičajena je fenomen među jednoćelijskim organizmima, gdje se geni mogu prenijeti između daleko povezanih vrsta. To može rezultirati stjecanjem novih osobina i genetske raznolikosti, što dodatno komplicira definiciju vrsta na temelju križanja.
Brza evolucija:jednoćelijski organizmi često imaju kratko vrijeme stvaranja i visoke stope mutacije, što dovodi do brze evolucije. To znači da se populacija može brzo divergirati genetski, čineći križanje između daleko povezanih pojedinaca s vremenom manje vjerojatnim.
Nadalje, koncept vrsta je ljudski konstrukt koji se koristi za kategorizaciju i razumijevanje raznolikosti života. Iako je kriterij koristan kriterij za definiranje vrsta u mnogim slučajevima, njegova primjena na jednoćelijske organizme može biti problematična zbog njihovih jedinstvenih karakteristika i reproduktivnih strategija. Umjesto toga, istraživači se često oslanjaju na kombinaciju genetskih, fenotipskih i ekoloških podataka kako bi razgraničili granice vrsta među jednoćelijskim organizmima.