Trilobiti: Ovi izumrli morski člankonošci široko su rasprostranjeni u Pirinejima. Napredovali su tijekom paleozoika, od razdoblja kambrija do razdoblja devona. Fosili trilobita mogu se pronaći na mnogim lokacijama, kao što su kambrijski škriljevci blizu Gavarniea u Francuskoj i u ordovicijskim vapnencima u području Vallibierna u Španjolskoj.
Amoniti: Amoniti su izumrli glavonošci, srodni današnjim lignjama i sipama. Obično se nalaze u mezozoičkim stijenama Pireneja, posebno u razdobljima jure i krede. Fosilizirani amoniti mogu se promatrati u vapnencima i laporima na mjestima kao što su Col de Ares u Francuskoj i Sierra del Montsec u Španjolskoj.
Ehinoidi (morski ježevi): Ehinoidi su morski beskralježnjaci s bodljikavim oklopima. Njihovi su fosili rasprostranjeni u Pirinejima, od paleozoika do tercijara. Mogu se pronaći u plitkim morskim naslagama kao što su kredni vapnenci u području Roncal u Španjolskoj.
Rudist školjkaši: Rudist školjkaši bili su u izobilju tijekom razdoblja kasne krede. Veliki su i često bizarnog oblika, tvoreći strukture grebena u nekim područjima Pireneja. Fosilizirani rudisti mogu se promatrati na lokacijama kao što su klanac Gavarnie i područje Luz-Saint-Sauveur u Francuskoj, kao iu nacionalnim parkovima Ordesa i Monte Perdido u Španjolskoj.
Nummulites: Numuliti su izumrle jednostanične foraminifere koje su živjele u toplim, plitkim morima. Fosili numulita česti su u eocenskim vapnencima u pirinejskom području, posebno u području Hecho u Španjolskoj i regiji oko Paua i Mauléona u Francuskoj.
Oligocenski sisavci: Pireneji su također dali važne fosile sisavaca iz oligocenske epohe, kao što su ostaci ranih primata, glodavaca i mesoždera, pružajući uvid u ranu evoluciju ovih skupina.
Ovo je samo nekoliko primjera raznolikih fosila pronađenih u Pirinejima. Složena geološka povijest i ekološki uvjeti planinskog lanca rezultirali su bogatom i važnom paleontološkom baštinom koja i dalje privlači znanstvenike i istraživače iz cijelog svijeta.