1. Indiana Bat (myotis sodalis):šišmiš u Indiani je mali smeđi šišmiš koji je federalno naveden kao ugrožen. Naseljava špilje i šumovita područja unutar parka. Zbog gubitka staništa i sindroma bijelog nosa, smrtonosne gljivične bolesti koja utječe na hibernaciju šišmiša, populacija šišmiša u Indiani značajno se smanjila.
2. Sivi vuk (Canis Lupus):Sivi vuk povijesno je bio prisutan u regiji Great Smoky Mountains, ali je iskorijenjen do početka 20. stoljeća zbog lova i progona. U tijeku su napori na ponovnom uvođenju sivog vuka u park, s potencijalnim prednostima za obnovu ekosustava i dinamiku grabežljivca.
3. ELK (CERVUS CANADENSIS):Elk je nekoć obilan u Velikim dimnim planinama, ali suočen je s padom stanovništva zbog pretilosti. Ponovno su uvedeni u park 2001. godine i od tada su uspostavili malu, ali rastuću populaciju. Elk se smatra ključnim kamencima jer njihovo ponašanje ispaše utječe na biljne zajednice i pruža stanište drugim divljim životinjama.
4. Virginia Northern Leteća vjeverica (Glaucomys Sabrinus Fuscus):Ova podvrsta sjeverne leteće vjeverice endemična je za južne Appalachian planine, uključujući Velike Smoky planine. Savezno je ugrožen zbog faktora poput gubitka staništa i fragmentacije. Napori o očuvanju usredotočeni su na zaštitu svojih preostalih staništa i rješavanje prijetnji.
5. Appalachian Trail Pupfish (Cyprinodon Vernalis):Appalachian Trail Pupfish je mala riba koja se nalazi u izoliranim planinskim potocima u parku. Navedena je kao ugrožena zbog ograničenog raspona i ranjivosti na degradaciju staništa i klimatske promjene.
Zaštita i očuvanje ugroženih vrsta vitalni je aspekt misije Nacionalnog parka Great Smoky Mountains da sačuva svoju bogatu biološku raznolikost. Različite mjere očuvanja, uključujući upravljanje staništima, programe praćenja i obrazovne inicijative, provode se kako bi se osiguralo opstanak ovih ranjivih vrsta.