Međutim, glodavci nisu glavni dio njihove prehrane . Jaguari će obično jesti glodavce samo kada je veći plijen oskudan ili nedostupan. Neke od specifičnih vrsta glodavaca koje jaguar može konzumirati uključuju:
* agoutis
* Paca
* štakori
* vjeverice
* Capybaras (Iako su to zapravo najveća vrsta glodavaca i mogu se smatrati većim plijenom)
Važno je napomenuti da će specifične vrste glodavaca koje jaguar jede ovisiti o lokaciji i dostupnosti plijena u svom staništu.