1. Pristranost očuvanja:Proces fosilizacije je rijedak i zahtijeva vrlo specifične uvjete. Većina se životinja brzo raspada zbog uklanjanja, mikrobne aktivnosti ili izlaganja elementima, ne ostavljajući tragove iza sebe. Da bi organizam postao fosiliziran, treba ga brzo sahraniti i zaštititi od propadanja, što se rijetko događa.
2. Meka tkiva:Većina životinja ima meka tijela koja su sklonija raspadanju od tvrdih tkiva poput zuba i kostiju. Manje vjerojatnije da će se organizmi mekog tijela, poput insekata, crva i meduza, sačuvati kao fosili u usporedbi sa životinjama s tvrdim strukturama.
3. Geološki procesi:Fosili nastaju kroz geološke procese koji se javljaju tijekom milijuna godina. Ti procesi uključuju sahranjivanje pod sedimentima, kompresiju i kemijsku promjenu. Mnoga područja Zemljine površine podliježu eroziji, tektonskoj aktivnosti i drugim geološkim događajima koji mogu uništiti ili izmijeniti fosile.
4. Okolišni čimbenici:Okoliš igra ključnu ulogu u fosilizaciji. Određena okruženja, poput visoko kiselih ili alkalnih tla, mogu otopiti ili raspadati kosti i školjke, smanjujući šanse za očuvanje. Uz to, okruženja koja doživljavaju ekstremne temperaturne promjene ili fluktuacije u razini vode možda neće pogoditi stvaranju fosila.
5. Konkurencija za svemir:Fosili se često nalaze u sedimentnim stijenama formiranim u drevnim okruženjima, poput riječnih delta, jezera i oceana. Ta su okruženja bila prepuna života, a ostaci više organizama natjecali su se za svemir i očuvanje. Samo bi mali dio tih organizama s vremenom postao fosiliziran.
Unatoč izazovima, fosilni zapis pruža vrijedan uvid u povijest života na zemlji. Fosili izumrlih vrsta omogućuju znanstvenicima da proučavaju drevne ekosustave, evolucijske odnose i paleoklimati, pridonoseći našem razumijevanju dinamične prirode biološke raznolikosti i povijesti planeta.