* Alge: Alge su raznolika skupina mikroskopskih organizama koji se nalaze u svim slatkovodnim okruženjima. Oni su važni primarni proizvođači, što znači da sunčevu svjetlost pretvaraju u energiju koju mogu koristiti drugi organizmi.
* Protozoa: Protozoji su jednocelični organizmi koji se nalaze u svim slatkovodnim okruženjima. Obično su grabežljivci ili čistači, a oni igraju važnu ulogu u raspadanju organske tvari.
* Rotiferi: Rotiferi su mikroskopske životinje koje se nalaze u svim slatkovodnim okruženjima. Oni su dovodnici filtra i igraju važnu ulogu u uklanjanju suspendiranih čestica iz vode.
* Cladocerans: Cladocerans su mali, rakiji zooplankton koji se nalaze u svim slatkovodnim okruženjima. Oni su dovodnici filtra i igraju važnu ulogu u uklanjanju suspendiranih čestica iz vode.
* Copepods: Kopepodi su mali, rakiji zooplankton koji se nalaze u svim slatkovodnim okruženjima. Oni su grabežljivci i igraju važnu ulogu u kontroli populacije fitoplanktona.
Mikroskopski organizmi u morskim okruženjima
* Phytoplankton: Fitoplankton je raznolika skupina mikroskopskih organizama koji se nalaze u svim morskim okruženjima. Oni su važni primarni proizvođači, što znači da sunčevu svjetlost pretvaraju u energiju koju mogu koristiti drugi organizmi.
* Zooplankton: Zooplankton su mikroskopske životinje koje se nalaze u svim morskim okruženjima. Obično su grabežljivci ili čistači, a oni igraju važnu ulogu u raspadanju organske tvari.
* ichthyoplankton: Ihtioplankton su jaja i ličinke ribe. Nalaze se u svim morskim okruženjima i igraju važnu ulogu u zapošljavanju nove ribe stanovništvu.
* Meroplankton: Meroplankton su ličinke bentoskih beskralješnjaka. Nalaze se u svim morskim okruženjima i igraju važnu ulogu u zapošljavanju novih bentoloških beskralješnjaka na populaciju.
* holoplankton: Holoplankton su mikroskopski organizmi koji cijeli život provode u planktonu. Nalaze se u svim morskim okruženjima i igraju važnu ulogu u prijenosu energije između različitih trofičkih razina.