Evo glavnih slojeva dubokog jezera:
1. Epilimnion:Ovo je gornji, najtopliji sloj jezera. Dobro je osvijetljen i sadrži veliku količinu kisika. Ovdje se događa većina fotosintetske aktivnosti, a perkton i drugi organizmi uspijevaju.
2. MetalIMNION:Ovo je sloj temperature brzo smanjenja koji odvaja epilimnion od hipolimniona. Poznat je i kao termoklina. Ovaj sloj može biti debljine nekoliko metara i djeluje kao barijera između gornjeg i donjeg sloja jezera, inhibirajući miješanje.
3. Hipolimnion:Ovo je dubok, hladan, donji sloj jezera. Slabo je osvijetljen i sadrži vrlo malo kisika. Voda u hipolimnionu je gušća i ne miješa se lako s gornjim slojevima. Ovaj sloj može biti stotine metara duboko u velikim jezerima.
4. Profundal Zone:Najdublji dio jezera naziva se profundalna zona. Karakteriziraju ga hladne temperature, niska razina kisika i ograničena vidljivost. Organizmi koji žive u ovoj zoni prilagođeni su tim teškim uvjetima.
Dakle, iako duboka jezera nemaju potpuno iste zone kao morski biom, pokazuju različita slojevima i promjenama u temperaturi, prodoru svjetlosti i razini kisika, što stvara različite ekološke niše i zajednice organizama.