1. Gubitak i degradacija staništa: Primarni faktor koji doprinosi padu kalifornijskog kondora je gubitak njegovog prirodnog staništa zbog ljudskih aktivnosti poput urbanog razvoja, poljoprivrede i sječe. Kondor je usko povezan sa četičanim šumama starog rasta i stjenovitim liticama za gniježđenje i korijenje. Kako su se ljudske aktivnosti upadale na ta područja, stanište Condora je fragmentirano i smanjeno.
2. Lov i pucanje: U prošlosti su kondori lovili za perje i smatrali su se prijetnjom stokom. Ovaj izravni progon pridonio je padu stanovništva. Iako je lov na kondor sada zabranjen, neki kondori se i dalje suočavaju s prijetnjama od ilegalnih pucnjava.
3. Otrovanje olova: Trovanje olovom značajan je uzrok smrti u kalifornijskim kondorima. Olovo može ući u tijelo Condora kada konzumiraju fragmente olovne municije koji su zaostali iz lova ili pucanja cilja. Olovo toksičnost utječe na živčani sustav Condora i vitalne organe, što dovodi do smrti.
4. Reproduktivni izazovi: Kalifornijski kondor je sporo reproducirajuća vrsta. Kondori se obično ne uzgajaju dok ne napune najmanje 6 godina, a mogu proizvesti samo jednu pilić svake druge godine. Ova spora reproduktivna stopa čini populaciju ranjivom na poremećaje i izazove.
5. Inbreeding i genetička pitanja: Zbog male veličine stanovništva, preostali kalifornijski kondori vrlo su osjetljivi na inbreeding. To može dovesti do smanjene genetske raznolikosti i povećane ranjivosti na bolest i druge izazove.
Napori o očuvanju provedeni su kako bi se zaštitila i oporavila populaciju kalifornijskog kondora, uključujući programe uzgoja u zatočeništvu, očuvanje staništa i uklanjanje olovne municije u lovačkim područjima. Ove su mjere pridonijele postupnom oporavku populacije Condor, ali njihov kontinuirani opstanak ovisi o stalnim naporima očuvanja i zaštiti njihovog staništa.