#### 1. Znanstveni program kitolova u Sjevernom Pacifiku i Antarktičkom oceanu (JARPA)
Program znanstvenog istraživanja kitolova, poznat i kao JARPA, provodi se prema posebnim dozvolama koje je izdala japanska vlada. JARPA je osmišljena za prikupljanje znanstvenih podataka o mnogim vrstama kitova, uključujući male kitove, sei kitove i kitove peraje. Međutim, prema međunarodnom morskom pravu, smrtonosna znanstvena istraživanja na životinjama dopuštena su samo ako druga nesmrtonosna sredstva nisu dovoljna za dobivanje potrebnih informacija.
Nakon što je Međunarodni sud pravde (ICJ) u ožujku 2014. presudio da japanski program JARPA II na Antarktiku nije bio u svrhu znanstvenog istraživanja, Japan je zaustavio taj program. Međutim, Japan je u prosincu 2015. započeo novi program, JARPA II posebna dozvola. Japanska vlada predstavila je popis od 12 znanstvenih pitanja kao znanstvenu osnovu za program. Međutim, ICJ je odlučio da program nije bitno izmijenjen u odnosu na program JARPA II i presudio je u prosincu 2021. da nastavak programa "znanstvenog kitolova" također krši međunarodno pravo.
#### 2. Obalni kitolov za lokalnu potrošnju
Japan također ima program obalnog lova na kitove koji cilja na kitove minke duž njegove obale. Vlada postavlja kvotu za broj kitova koji se mogu uloviti iz svake skupine ili jata kitova. Meso ulovljenih kitova zatim se prodaje lokalno.
Međutim, skupine za očuvanje izrazile su zabrinutost oko održivosti obalnog kitolova. Tvrde da su kvote previsoke i da je teško točno pratiti populaciju kitova u obalnim vodama.