* Rumen: Stoka ima specijalizirani želudac zvan rumen, koji je fermentacijska komora. Ovo okruženje uglavnom je bez kisika, što ga čini idealnim za napredak anaerobnih bakterija.
* Digestivni procesi: Anaerobne bakterije igraju ključnu ulogu u razbijanju složenog biljnog materijala poput celuloze, koju stoka konzumira. Ovaj postupak, poznat kao fermentacija, proizvodi isparljive masne kiseline (VFA) koje stoci pružaju energiju.
* Osjetljivost na kisik: Iako neke aerobne bakterije mogu postojati u crijevima, njihov je broj značajno niži u usporedbi s anaerobnim bakterijama. To je zato što je okruženje rumena ugrožena kisikom, a mnoge aerobne bakterije ne mogu preživjeti u takvim uvjetima.
Stoga je većina bakterija u crijevima goveda, posebno u rumenu, anaerobna.