Najznačajniji čimbenik koji doprinosi ugroženju meksičkog vuka je gubitak staništa. To je uglavnom zbog pretvorbe prirodnih staništa u poljoprivredna i urbana područja. Kao rezultat toga, meksički vukovi izgubili su pristup svojoj prirodnoj bazi plijena i prikladnim mjestima denniranja.
2. Lov i hvatanje
Povijesno su meksički vukovi lovili i zarobljeni za svoje krzno i kao sredstvo kontrole grabežljivca. Ovo neselektivno ubijanje vukova dodatno je smanjilo njihovo stanovništvo.
3. hibridizacija
Meksički vukovi usko su povezani s kojotima, a dokumentirano je križanje između dviju vrsta. Hibridizacija može dovesti do razrjeđivanja genetskog integriteta meksičkog vuka i gubitka jedinstvenih prilagodbi koje su ključne za opstanak u njihovom prirodnom okruženju.