Primarna prijetnja majmuna Uakari je krčenje šuma. Amazonska prašuma, u kojoj borave, suočila se s opsežnom sječanjem i čišćenjem zemljišta u različite svrhe kao što su poljoprivreda, ranč na goveda, rudarstvo i širenje ljudskih naselja. Ovaj značajan gubitak staništa frakturirao je i izolirao populaciju, smanjujući genetsku raznolikost i čineći ih ranjivim na pad.
Lov
UAAKARI Majmuni se love zbog hrane i trgovine na crnoj tržištu egzotičnih kućnih ljubimaca. Njihovo karakteristično crveno ili narančasto krzno čini ih posebno privlačnim kolekcionarima. Pritisak lova uvelike je utjecao na divlje populacije, čak i u udaljenim područjima.
Klimatske promjene
Klimatske promjene predstavljaju prijetnju majmunima Uakari i Amazonskoj prašumi. Izmijenjeni obrasci oborina, porast temperature i promjenjivu vegetaciju mogu utjecati na njihove izvore hrane i poremetiti dinamiku ekosustava. Ovi izmijenjeni uvjeti mogu negativno utjecati na preživljavanje, reprodukciju i opće zdravlje majmuna.
Ostali čimbenici
Majmuni Uakari podliježu i drugim prijetnjama, uključujući zarazne bolesti koje se prenose od ljudi, fragmentacija staništa zbog izgradnje cesta i potencijalno onečišćenje njihovog okoliša iz rudarske i poljoprivredne aktivnosti. Ovi dodatni izazovi doprinose njihovom ugroženom statusu.