Tijekom sezone uzgoja, Little Auks se hrani uglavnom na Zooplanktonu, uključujući Copepods, Amphipods i Krill. Također jedu malo male ribe, poput pijeska i drugih beskralješnjaka, poput lignje i škampi.
Zimi, kada je Zooplankton manje obilan, mali Auks prelazi na prehranu koja se sastoji uglavnom od male ribe, poput kapelina, pijeska i haringe. Također jedu neke beskralješnjake, poput lignji i škampi.
Mali Auks su oportunistički hranilice i iskoristit će bilo koji raspoloživi izvor hrane. Poznato je da jedu insekte, bobice, pa čak i male sisavce.