Pigmy sove obično jedu razne male životinje, uključujući insekte, male glodavce i ptice. Oni su oportunistički grabežljivci i pojest će bilo koji plijen dostupan.
Insekti čine veliki dio prehrane pigmy sove. Jedu razne insekte, uključujući bube, moljce, cvrčke i skakavice. Pygmy sove jedu i male glodare, poput volusa, miševa i šljokica.
Povremeno će pigmy sove jesti male ptice. Obično će ciljati male, prolazne ptice, poput vrapca, finča i pilića.