Muhe se često hrane propadajućim materijom i otpadnim proizvodima, što ih može izložiti nizu mikroorganizama koji uzrokuju bolest. Kad muhe slete na hranu ili druge površine, one mogu prenijeti ove mikroorganizme kroz svoju slinu ili izmet. Konzumiranje ovih kontaminiranih muha ili njihovih izlučivanja dovodi pojedince u opasnost od gastrointestinalnih bolesti i infekcija.
Uz to, neke leteće vrste mogu akumulirati otrovne tvari u svojim tijelima, poput teških metala ili pesticida, koji mogu predstavljati zdravstvene rizike ako se konzumiraju.
Stoga se općenito ne preporučuje namjerno jesti muhe, osim ako ne dolaze iz kontroliranog izvora ili su posebno pripremljeni za ljudsku konzumaciju. Ako postoji kulturna ili tradicionalna praksa jedenja određenih vrsta muha, važno je napraviti temeljito istraživanje i konzultirati se s pouzdanim izvorima kako bi se osigurala sigurnost i pravilno rukovanje prije nego što ih konzumirate.